При гострому бактеріальному простатиті протимікробні препарати, за EAU, рятують життя, а при хронічному — рекомендовані. Найкращим EAU вважає лікування з урахуванням результату посіву, але при гострій формі радить розглянути емпіричне лікування, тобто до отримання результату, в усіх пацієнтів. Якщо людина в тяжкому загальному стані, EAU віддає перевагу парентеральному введенню (наприклад, внутрішньовенному), а після нормалізації показників інфекції можливий перехід на таблетки. Тривалість курсу визначає лікар. Для хронічного бактеріального простатиту EAU першою лінією називає фторхінолони, а якщо збудник — внутрішньоклітинна бактерія (наприклад, хламідія), рекомендує макроліди або тетрацикліни.
Приблизно в 10 % чоловіків із гострим бактеріальним простатитом, за EAU, виникає затримка сечі. Тоді сечу виводять катетером через уретру або через прокол над лобком. При абсцесі простати, за EAU, можливі і дренування, і консервативне лікування, тактика може залежати від розміру абсцесу.
Введення антибіотиків безпосередньо в простату, за EAU, у контрольованих дослідженнях не оцінювали, і настанова пише, що такий метод не слід розглядати. Якщо симптоми тримаються, а аналізи знову виявляють збудників інфекцій, що передаються статевим шляхом, EAU рекомендує обстежити партнерку чи партнерів.