За українською адаптованою настановою „Якість ендоскопічних гастроінтестинальних втручань“ (ДЕЦ МОЗ, 2017), до можливих ускладнень гастроскопії належать кровотеча, перфорація (отвір у стінці органа), інфекції та побічні ефекти седації чи анестезії; NHS наголошує, що ускладнення гастроскопії рідкісні. Після колоноскопії в рідкісних випадках можливі реакція на седацію, сильна кровотеча та невеликий розрив стінки кишки. Про біопсію загалом NHS пише, що після неї можуть бути біль чи дискомфорт, інколи інфекція, а при деяких видах біопсії є ризик внутрішньої кровотечі. Звичайні явища: після гастроскопії біль у шлунку й горлі, що має минути за кілька годин; після колоноскопії здуття чи спазми 2–3 години й трохи крові в калі протягом кількох днів. Про седацію та її наслідки — на сторінці «Седація під час ендоскопії».
NHS радить терміново звернутися до закладу, де проводили гастроскопію, якщо після неї з’явилися висока температура, відчуття жару, холоду чи озноб, а також чорні, як дьоготь, випорожнення. Після колоноскопії NHS радить те саме при сильній кровотечі з заднього проходу чи кровотечі, що посилюється, сильному болю в животі чи болю, що наростає, високій температурі.
Якщо після гастроскопії блювання не припиняється, ви блюєте кров’ю, відчуваєте задишку, сильний біль у животі чи грудях або біль, що посилюється, NHS у таких випадках радить викликати швидку або негайно їхати до відділення невідкладної допомоги. В Україні телефонуйте 103 — диспетчер вирішить, чи направити бригаду, — або попросіть когось негайно відвезти вас до лікарні (не сідайте за кермо самі).
Одразу телефонуйте 103 при значній зовнішній кровотечі, блюванні кров’ю, гострому болю в черевній порожнині чи/та поперековому відділі, ознаках внутрішньої кровотечі (різке падіння артеріального тиску, наростання частоти пульсу, різка загальна слабкість та блідість шкіри тощо), раптовому болю в грудній клітці та інших станах, які загрожують життю та здоров’ю (Правила виклику бригад екстреної медичної допомоги, наказ МОЗ № 583, п. 4). Якщо сумніваєтеся, телефонуйте 103: диспетчер вирішить, чи направити бригаду, або порадить, куди звернутися (п. 11).