Копрограму часто плутають з «аналізом на дисбактеріоз». Інформаційна стаття МОЗ України «Чому не варто лікувати „дисбактеріоз“» (11.04.2018) пояснює: міжнародна медицина такого діагнозу не знає, а аналіз, на який в Україні направляють пацієнтів, охоплює лише частину мікроорганізмів і не відображає реальної картини; в різних лабораторіях результати можуть різнитися. Під „дисбактеріозом“ можуть ховатися інші стани, наприклад синдром подразненого кишківника, лактазна недостатність чи кишкова інфекція, і їх досліджують окремо. Міжнародний консенсус 2025 року про тестування мікробіому (Lancet Gastroenterology & Hepatology, анотація) також зазначає, що доказів клінічної користі таких тестів мало.
Розбіжність є і в самих документах. У протоколі 2014 року про неалкогольний стеатогепатит (наказ МОЗ від 06.11.2014 № 826; клінічна настанова до нього в реєстрі ДЕЦ позначена як застаріла) серед лабораторних методів стоїть «Копрограма, кал на дисбіоз». Ми спираємося на пізнішу позицію МОЗ і консенсус 2025 року. У протоколах № 1204 і № 1742 копрограму не пов’язано з оцінкою мікрофлори, тож чекати від неї такого висновку не варто.