Як і будь-яка операція, венектомія має ризики. ESVS наводить дані порівняння з лазерною абляцією: після стрипінгу частіше траплялися кровотеча і гематома (4,8 % проти 1,3 %), інфекція рани (1,9 % проти 0,3 %) і парестезії — оніміння чи поколювання шкіри (11,3 % проти 6,7 %). Також, за ESVS, при хірургічному лікуванні більша крововтрата під час операції.
Британська NHS серед чинників ризику тромбозу глибоких вен (ТГВ) називає операцію і попереджає, що тромб може утворитися й через кілька тижнів після неї. Ознаки ТГВ за NHS: пульсівний біль в одній нозі (рідко в обох), зазвичай у литці чи стегні; набряк однієї ноги; почервоніння, посиніння або потемніння шкіри навколо болючого місця; набряклі вени. З такими ознаками терміново зверніться до лікаря, не чекаючи планового запису. Якщо до них додалися задишка чи біль у грудях, NHS у таких випадках радить викликати швидку або негайно їхати до відділення невідкладної допомоги. В Україні телефонуйте 103 — диспетчер вирішить, чи направити бригаду, — або попросіть когось негайно відвезти вас до лікарні (не сідайте за кермо самі).